Afin qu’ils puissent être les acteurs de leur protection sociale, adaptée à leurs spécificités professionnelles, les indépendants sont appelés à voter, tous les 6 ans pour désigner parmi leurs pairs, ceux qui seront chargés de gérer leur régime.

Chaque caisse RSI est administrée par un conseil d'administration composé de travailleurs indépendants qui sont élus par les ressortissants du RSI, au suffrage direct.

Les administrateurs s'engagent au service de l’intérêt général des professions indépendantes : ce mandat fait d'eux les porte-parole de chacun des assurés, actifs ou retraités.

Ils représentent, font évoluer et défendent la protection sociale des travailleurs indépendants.

Le Conseil d’administration détermine, notamment, par ses délibérations la politique générale de la caisse RSI. Il examine et vote les budgets de gestion et d’intervention et approuve les comptes annuels de la caisse.

Certaines demandes individuelles font l’objet de décisions au sein de commissions où siègent les administrateurs (recours amiable, action sanitaire et sociale...).

Les administrateurs assurent également la représentation de leur caisse auprès d’institutions territoriales comme les Agences Régionales de Santé (ARS), les commissions conventionnelles des professions de santé, les Comités Départementaux des Retraités et des Personnes Âgées (CODERPA), etc..